مقدار پروتئین خام موجود در پودر ماهی بستگی به نوع و منبع ماهی مورد استفاده دارد، اما به‌طور کلی پودر ماهی با کیفیت معمولاً حاوی حدود 60 تا 72 درصد پروتئین خام است. این مقدار می‌تواند کمی بر اساس فرآیند تولید و ماهی‌های خاص استفاده شده در تولید تغییر کند. پودر ماهی به دلیل محتوای بالای پروتئین و دیگر عناصر مغذی، به‌طور گسترده‌ای در تغذیه دام‌ها و آبزیان به‌عنوان منبع پروتئین استفاده می‌شود.